En las subastas realizadas en el portal de subastas del BOE, el depósito se hace en el apartado "Pujas" de la subasta mediante transferencia bancaria.
En las subastas de la Seguridad Social, se hace mediante cheque bancario el día de la subasta.
Aunque, ten en cuenta, que solo puedes realizar el depósito desde algunos bancos. Aquí tienes el listado de entidades bancarias autorizadas por el portal del boe.